در روز دوم اجلاس حوزه‌های علمیه، آیت الله محسن اراکی بیان کرد که یکصدمین سالگرد این حوزه‌ها می‌تواند یک رویداد تحول‌آفرین باشد. وی تاکید ریاست جمهوری بر تغییرات حوزه علمیه را بیان کرده و تصریح کرده که علمای شیعی هرگز از جامعه جدا نشده‌اند و همیشه به نیازهای جامعه پاسخ داده‌اند. در ادامه این مکالمه، آیت الله اراکی مسئولیت علمای شیعی را بر پایگانشان نهاد و آنها را وارثان انبیاء دانست و موضوع اول اینکه علمای شیعی باید حوادث جهان و جامعه خود را رصد کنند را مطرح کرد. به بیان وی اگر این حوادث برخی از آنها جنبه شیطانی داشته باشد، جنگ ما با دشمنان و نه با مردم است و جنگ بر سر حاکمیت الهی و شیطانی است. در ادامه، به رصد جریان‌های فرهنگی و فرهنگی تبیین اشاره شده است و همچنین می‌توان اشاره کرد که علمای شیعی باید نقش خود را در هدایت جامعه تا تسخیر اعجاب‌انگیز به بهترین نحو ممکن بازی کنند.