در روز 16 اسفندماه 1403، سازمان بسیج طلاب و روحانیون حوزه علمیه قم در پی هتک حرمت به ساحت مقدس و شامخ مرجعیت شیعه و هجمه به فقیه بصیر و مفسّر روشن ضمیر قرآن کریم، حضرت آیت‌الله علامه جوادی آملی، بیانیه‌ای صادر کرد. این بیانیه از جمله نکات زیر را طرح کرد:
1. تلاش صف694عات برای خاموش کردن نور الهی در عمل تلخ و درد آور است که نمی‌توان آن را به‌عنوان حرکتی ابلهانه از سوی چند عنصر فرومایه و بد سابقه تلقی کرد. بلکه گمراهان کوردل و شرکای شیطان بزرگ در شهر جهاد و اجتهاد، سالهاست دور هم جمع شده‌اند تا به خیال خام خود، نور خدا را با دهان خود خاموش کنند. هرچند که خدای متعال اراده کرده است نور خود را تکمیل و تتمیم گرداند. برایمان علم عمیق است که انوار قدسیه الهی به اراده ذات اقدس اله، توسط بزرگ رهبر جهان اسلام و همراهی مرجعیت انقلابی شیعه همچون خورشیدی جهان افروز، به سرتاسر عالم نورافشانی می‌کند و هرگز خاموش شدنی نیست. ده سالهای دشمنی جبهه کفر و نفاق نشان داده است که اقدامات سخیف و اهانت‌های کودکانه مدعیان آزادی اندیشه و بیان، تنها و تنها موجب تلألو بیش از پیش آفتاب جهان تاب ولایت در ضمیرهای آگاه و قلوب نورانی مردان و زنان الهی گشته است.
2. سخنان عمیق و دقیق فقیه مفسّر حضرت آیت‌الله العظمی علامه جوادی آملی در حمایت از نظام اسلامی و ضرورت تبعیت کامل از «ولی فقیه زمان» و همچنین تمجید مثال زدنی رهبر معظم انقلاب از این عالم بزرگ و فقیه گرانقدر شیعه، پروژه طولانی مدت تحقق «آنتی تز انقلاب» از درون حوزه علمیه قم و نقشه استعماری «تقابل مرجعیت با ولایت» را با چالش اساسی روبرو کرد.
3. هرچند کینه و حقد عناصر معلوم الحال خرده جریان سکولار حوزوی با آیت الله العظمی علامه جوادی آملی، برای این روزها نبوده و به دهه هفتاد شمسی بلکه سالیان نخستین انقلاب شکوهمند اسلامی بازمیگردد که آیت الله العظمی علامه جوادی آملی در جلسات درس، سخنرانی‌ها و کتاب گرانسنگ «ولایت فقیه؛ ولایت فقاهت و عدالت» به دفاع تمام قد از نظریه ولایت فقیه و رد عالمانه و فقیهانه‌ی ادعاهای بدخواهان اسلام و انقلاب پرداختند.
4. سازمان بسیج طلاب و روحانیون حوزه علمیه قم ضمن ابراز تاسف و تاثر از هتک حرمت به ساحت رفیع مرجعیت، از هرگونه اهانت به ساحت بزرگان و سرمایه‌های نظام در حوزه علمیه قم که مهد اخلاق و فضیلت و کرامت است ابراز انزجار نموده و از همه مراجع عظام تقلید (حفظهم الله تعالی) و دلسوزان اسلام و انقلاب و نظام می‌خواهد در این شرایط حساس که کشور از همه سو مورد هجمه جبهه کفر و استکبار و نفاق قرار گرفته و از برخی سوء مدیریت‌های اجرایی در داخل رنج می‌برد، در برابر اینگونه حرکات ناشایست علیه کیان مرجعیت اسلام و ولایت فقیه موضع گیری صریح و آشکار نماید و نگذارند که عناصر فرصت طلب، وحدت کلمه جامعه و ساحت مقدس حوزه علمیه و مقام شامخ مرجعیت را اینگونه آماج حملات خود کنند.
5. در پایان یقین وافر دارد ان شاءالله با اراده خدای منان و رهبری داهیانه امین امت، رهرو پیر خمین، حضرت آیت الله العظمی امام خامنه ای(مدّ ظلّه العالی) در آینده‌ای نه چندان دور اضمحلال مستکبرین جهان و در رأس آن شیطان بزرگ را توسط پرورش یافتگان مکتب امام راحل عظیم الشان و حاج قاسم عزیز، به نظاره خواهیم نشست و خفاشان هراسناک از نور ولایت و مرجعیت، آرزوی خود برای تحقق سه گانه شوم “هراس افکنی، اختلاف افکنی و یاس آفرینی” را به گور خواهند برد؛ چرا که قدرت و اراده خداوند متعال، بر همه قدرت‌ها و اراده‌ها پیروز است.